行政部门

校长办公室(院士办公室)

纪检处

审计处

发展研究中心(高教研究所)

人事处(教师中心)

教务处(本科生院、教师教学发展中心、教学质量监控与评估中心、现代教育技术中心、课程中心)

科学技术处

财务处

就业与创新创业指导服务中心

学生处(学生中心、心理健康教育与咨询中心)

研究生处(研究生院)

基本建设办公室

资产与实验室管理处(云南农业大学资产经营有限责任公司)

对外合作交流处(港澳台事务办公室)

保卫处

离退休处

校友会办公室